Đức Đạt Lai Lạt Ma V, Lobsang Gyatso, sinh năm 1617 tại vùng Lhoka Chingwar Taktse, nằm ở phía Nam Lhasa, cha Ngài tên là Dudul Rabten và mẹ Ngài tên là Kunga Lhanzi.
Khi Sonam Choephel, thị giả chính của Đức Đạt Lai Lạt Ma IV, nghe nói về những khả năng đặc biệt của cậu bé Chong-Gya, ông đã đến thăm và cho cậu bé xem nhưng vật dụng trước đây của Đức Đạt Lai Lạt Ma IV. Cậu bé ngay lập tức nói rằng tất cả những vật dụng đó là của mình. Sonan Choephel đã giữ kín việc tìm thấy hóa thân lần thứ năm của Đức Đạt Lai Lạt Ma vì tình hình chính trị lúc đó rất hỗn loạn. Khi mọi việc lắng xuống, Đức Đạt Lai Lạt Ma V đã được đưa đến tu viện Drepung, nơi Ngài được Đức Ban Thiền Lạt Ma IV, Lobsang Chogyal, cho thọ giới tu sĩ và ban Pháp danh là Ngawang Lobsang Gyatso.